Pigments eumélanine et phéomélanine
La production et la quantité produite de ces deux pigments et donc la couleur du pelage du chien, sont déterminés par de nombreux gènes (environ 14). Cependant, la couleur de base du pelage du chien est déterminée par l'interactions de 3 gènes, qui sont appelés : locus E, locus K et locus A. Les interactions entre ces 3 gènes sont présentées dans le tableau ci-dessous.
D’autres gènes jouent un rôle clé en modifiant la couleur de la robe de base du chien. Ces gènes peuvent assombrir ou éclaircir le pelage du chien ou ils peuvent également entraîner des patrons de couleur (panachage).
Locus A, K et A
- le Ay pour le fauve ou sable. Y signifie jaune.
- le aw qui est l’allèle de type sauvage. Il est aussi appelé wolf sable. Chaque poil a 6 bandes alternées noir et feu.
- le at qui est la couleur du pelage noir et feu
- le a qui est le caractère récessif noir suite à l'absence de production de phaeomélanine
- Lla ayt signifie recombinant fawn et a été observée chez l’épagneul du Tibet et le dogue du Tibet.
- K qui est le noir dominant. Le locus A n’a aucun effet sur le noir dominant. Cependant, il y a un effet des locus B, D et M.
- kbr qui est responsable de la couleur de robe bringé. La couleur bringé est due à la présence de bandes d’eumélanine dans toutes les régions où il y a du feu (tan). L’intensité du bringé est influencée par le locus A.
- ky est les types sauvages et tous les autres locus peuvent être exprimés avec cet allèle.

Locus E

e/e
Rouge récessif
Aucun effet de K et de A

E/e, E/E ou Em Eg Eh allèles

Locus K

k/k

locus A
Voir le tableau locus A ci-dessous

K/K, K/k, K/kbr
noir dominant
Pas d’effet du locus A. Effet de M, B, D

kbr/kbr, kbr/k
Bringé
L'intensité du bringé dépend du locus A

Locus A

Ay/aw, Ay/at, Ay/a
Fauve ou sable

aw/aw, aw/at, aw/a
Grey Wolf (agouti)

at/at, at/a
Noir et feu ou tricolore

a/a
Noir récessif
Le locus E et les masques de couleur sur la tête du chien
- Em qui est le masque mélanique. Le masque n’est pas présent chez le chien de couleur noir dominant ou noir récessif. Le masque est présent dans les chiens de couleur sable ou fauve, noir et feu et wolf gray (agouti). En fonction de la race, le masque peut s'étendre jusqu'à la poitrine et les jambes.
- EG qui se traduise par la couleur de robe grizzle ou domino. Cette couleur de la robe se retrouve chez le Lévrier Persan, Lévrier afghan et Barzoi.
- E est l'allèle de base et permet la pleine expression des locus A et K.
- Eh est la couleur cocker sable et se retrouve chez le Cocker spaniel seulement.
- e est la couleur fawn récessif ou fawn clair.

Locus E

e/e
Rouge récessif
Aucun effet de K et de A

E/E, E/e
Aucun effet de E
Effet de K et de A

Em/Em, Em/E, Em/e
Masque mélancolique
Peut être caché par d’autres couleurs

Eg/e, Eh/E, Eh/e
Sable (Cocker)
Cocker anglais seulement

Eg/Eg, Eg/E, Eg/e
Grizzle/Domino
Nécessite Tan sur le locus A
Les gènes qui modifient la couleur de base du pelage du chien
le Locus B

Couleur de base de la robe
Locus E, K, A

B/B, B/b
Non brun

b/b
Brun
Locus D

Couleur de base de la robe
Locus E, K, A

D/D, D/d
Non dilué

d/d
dilué
Locus S
- S qui est un chien non spotting. Cependant, de petites zones blanche peuvent apparaître sur la queue ou sur les ongles.
- si est appellé le spotting irlandais (Irish spotting).
- sP est appelée Piebald. La quantité de taches varie en fonction de la race et de chaque chien.
- sw est appelé extreme piebald spotting. Ce locus abouti à une robe presque entièrement blanche.

Couleur de base de la robe
Locus E, K, A

S/S
Aucune taches blanches

S/sp, sp/sp
Taches blanches
Locus M et H
- M/m : génotype dont 50 % du noir de la robe se transforme en argent.
- M/M génotype appelé double merle. Le noir est remplacé par environ 25 % de noir, environ 50 % d’argent et environ 25 % de blanc.

Couleur de base de la robe
Locus E, K, A

Locus M
Locus H

M/m H/h
Merle Harlequin

M/m h/h
Merle, Non Harlequin

m/m H/h
Non merle non harlequin

m/m h/h
Non merle non harlequin
Autres gènes théoriques qui influencent la couleur de robe du chien
Locus I (intensité)
Locus C (couleur)
- C qui est n'a pas d'influence sur la couleur (full color).
- cch pour Chinchilla
- cE qui est une dilution extrême
- cB, cP qui sont les albinos aux yeux bleus et le platine (Platinum)
- ca qui est l'albino. Cependant l'existence de vrai albino chez chien n’a pas été prouvée.